鞭毛馬達(dá)結(jié)構(gòu)(左)及其工作機(jī)制示意圖
自17世紀(jì)列文虎克第一次觀察到能夠移動(dòng)的細(xì)菌后,細(xì)菌運(yùn)動(dòng)能力及其機(jī)制引起了科學(xué)家的強(qiáng)烈興趣。細(xì)菌是怎么跑得這么快的?它是什么樣的跑法?一連串的疑問盤繞在科學(xué)家的腦海里,很多科學(xué)家加入這一研究領(lǐng)域,然而很多疑問依然有待解開。
4月20日,《細(xì)胞》雜志刊登浙江大學(xué)生命科學(xué)研究院教授朱永群團(tuán)隊(duì)與醫(yī)學(xué)院教授張興團(tuán)隊(duì)合作研究成果,揭示了沙門氏菌鞭毛馬達(dá)的原子分辨率結(jié)構(gòu)。這是一個(gè)6.3兆達(dá)爾頓(MDa)的超大復(fù)合物,包含了12種不同的蛋白質(zhì),總共有175個(gè)亞基。通過對(duì)鞭毛馬達(dá)扭矩傳輸機(jī)制的剖析,解開了困惑學(xué)界幾十年的細(xì)菌鞭毛馬達(dá)工作原理難題,揭開了細(xì)菌跑得快的秘密,為抗生素設(shè)計(jì)提供了新思路。
朱永群表示,這項(xiàng)工作是細(xì)菌領(lǐng)域的一個(gè)重要突破,之前很多關(guān)于鞭毛馬達(dá)的推論現(xiàn)在被證明是不對(duì)的。自然界還有一種分子馬達(dá)叫“ATP合成酶”,研究證明鞭毛馬達(dá)的扭矩傳輸機(jī)制完全不同于ATP合成酶,說明自然界分子馬達(dá)工作原理的多樣性,為更好地了解微觀世界的分子發(fā)動(dòng)機(jī)奠定了基礎(chǔ)。
張興說,細(xì)菌鞭毛是一個(gè)精巧復(fù)雜的機(jī)器,是自然界分子進(jìn)化的杰作。這項(xiàng)研究通過對(duì)鞭毛馬達(dá)的結(jié)構(gòu)解析,不僅從原子水平揭示了其工作原理,為納米機(jī)器的研究帶來積極的啟發(fā)意義,也為研究這個(gè)復(fù)雜納米機(jī)器的起源進(jìn)化提供了可靠的結(jié)構(gòu)信息,為生物進(jìn)化理論帶來新的視角。
細(xì)菌與人類等其他生物具有漫長(zhǎng)的生物共進(jìn)化過程,為了避免被人類免疫系統(tǒng)追殺,或者為了成功找到適宜的生存和感染的位置,細(xì)菌進(jìn)化出了快速“游動(dòng)”的能力。
細(xì)菌這一快速游動(dòng)的能力是基于一個(gè)特殊的運(yùn)動(dòng)器官——鞭毛。鞭毛馬達(dá)旋轉(zhuǎn)并產(chǎn)生動(dòng)力,通過扭矩傳輸給接頭裝置,然后傳給鞭毛絲,從而帶動(dòng)鞭毛絲的轉(zhuǎn)動(dòng)。
鞭毛馬達(dá)是自然界中最復(fù)雜的蛋白質(zhì)機(jī)器之一,它能夠每秒鐘旋轉(zhuǎn)300-2400圈。世界上70%的細(xì)菌都具有鞭毛,之前微生物遺傳學(xué)家和生物化學(xué)家對(duì)鞭毛馬達(dá)進(jìn)行了大量的研究,對(duì)鞭毛馬達(dá)進(jìn)行了很多描述,然而其工作原理依然很不清楚。
“為了解決這一世界難題,我們希望解析它的高分辨結(jié)構(gòu)。我們碰到的第一個(gè)難點(diǎn)就是如何完整地提取鞭毛馬達(dá),它太大了。”朱永群說。團(tuán)隊(duì)經(jīng)過大量的嘗試,通過遺傳改造的方法,改變了傳統(tǒng)極易破壞結(jié)構(gòu)的酸堿處理法,設(shè)計(jì)出溫和的純化步驟,最終獲得了來源于沙門氏菌的完整的鞭毛馬達(dá)與接頭裝置的復(fù)合物樣品,并與浙江大學(xué)冷凍電鏡中心主任張興教授合作,利用300千伏冷凍電鏡平臺(tái),收集了冷凍電鏡數(shù)據(jù),首次解析了原子分辨率的鞭毛馬達(dá)結(jié)構(gòu)。
細(xì)菌為什么能跑得那么快?浙大科研人員解析的這個(gè)鞭毛馬達(dá)結(jié)構(gòu)清晰地揭示了其中的奧秘。鞭毛馬達(dá)含有質(zhì)子泵,通過轉(zhuǎn)運(yùn)氫離子,帶動(dòng)質(zhì)子泵的轉(zhuǎn)動(dòng),將化學(xué)能轉(zhuǎn)變?yōu)闄C(jī)械能,繼而將扭矩傳給鞭毛馬達(dá)的內(nèi)膜環(huán),促使內(nèi)膜環(huán)的轉(zhuǎn)動(dòng)。
內(nèi)膜環(huán)結(jié)構(gòu)非常特殊,它不僅可以旋轉(zhuǎn)和傳輸扭矩,而且是整個(gè)鞭毛馬達(dá)的組裝底座。
正因?yàn)榻Y(jié)構(gòu)的獨(dú)特性以及各個(gè)結(jié)構(gòu)元件之間相互精妙的配合,鞭毛馬達(dá)能將質(zhì)子泵轉(zhuǎn)化而來的機(jī)械能,毫無(wú)損耗地迅速傳給鞭毛絲,促進(jìn)鞭毛絲高速轉(zhuǎn)動(dòng)。細(xì)菌有了如此非凡的“風(fēng)火輪”裝備,進(jìn)而得以快速運(yùn)動(dòng)。
細(xì)菌鞭毛是微生物學(xué)課本的基本內(nèi)容,這項(xiàng)工作終于向人們揭開了其神秘面紗,鞭毛馬達(dá)工作機(jī)制的揭示更具有教科書級(jí)別的科學(xué)意義。
一位評(píng)審專家說,這是一個(gè)里程牌的結(jié)構(gòu)研究工作。另一位評(píng)審專家表示,這是一件杰出的研究工作,它揭示了細(xì)菌鞭毛未知部分的無(wú)與倫比的高分辨率精細(xì)結(jié)構(gòu)和鞭毛馬達(dá)工作原理。
相關(guān)論文信息:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00430-X
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