浙江大學(xué)徐建明教授團(tuán)隊(duì)通過分析地球微生物組計(jì)劃大數(shù)據(jù),構(gòu)建了全球微生物共存網(wǎng)絡(luò)。通過對微生物“社會關(guān)系”的分析,揭示了地球多種環(huán)境中,微生物組之間的互聯(lián)模式。
這項(xiàng)研究近日發(fā)表在微生物領(lǐng)域期刊《微生物組》,合作者還包括美國加州大學(xué)圣迭戈分校、美國太平洋西北國家實(shí)驗(yàn)室以及比利時魯汶大學(xué)。
單個微生物在數(shù)量眾多的群落中繁衍生息,不同微生物間存在著共生、寄生、捕食和競爭等關(guān)系。微生物不僅僅是“分解者”,它們還能影響到溫室氣體、綠色生產(chǎn)、人體健康的方方面面,其群落組成和功能具有極高的復(fù)雜性。
“過去科研人員常常在微觀尺度挖掘其具體特性,但有時如同盲人摸象,只能看到局部。就像人類社會,光是知道一個人叫什么名字,無法了解人類社會的全貌,要知道人與人之間的關(guān)系才能更好地描述。”徐建明說。
浙大科研人員通過構(gòu)建微生物生態(tài)網(wǎng)絡(luò)算法,建立了一個“篩子”,篩出微生物之間的交互作用,采用了來自土壤、植物、動物等14個環(huán)境中的23000多個樣本,構(gòu)建了全球微生物共存網(wǎng)絡(luò)。
“采用統(tǒng)一采樣、測序、分析的全球最大標(biāo)準(zhǔn)化環(huán)境微生物組數(shù)據(jù)庫的建立,為中外科學(xué)家研究確定了豐富的數(shù)據(jù)資源?!毙旖髡f。
通過這張網(wǎng)絡(luò),研究人員們發(fā)現(xiàn),土壤微生物組與動物表面、動物腸道和淡水微生物組有密切關(guān)系,而植物、動物體表的微生物是連接兩組微生物網(wǎng)絡(luò)的“橋梁”。
“通過這張網(wǎng)絡(luò),我們對微生物的關(guān)系看得更清,為進(jìn)一步理解運(yùn)行機(jī)制提供了前提?!毙旖髡f。
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