生物機(jī)器人,不僅可以給癌細(xì)胞送藥,還能清除海洋微塑料,更可能為多細(xì)胞生物起源提供啟示。
活細(xì)胞機(jī)器人。|來源:Douglas Blackiston
作者|湯波 分子生物學(xué)博士
編輯|陳天真
說到機(jī)器人,你想到的大概是有著金屬身體,由計(jì)算機(jī)程序給出指令、自動(dòng)執(zhí)行任務(wù)的智能機(jī)器。不過,科學(xué)家正在利用DNA、細(xì)胞創(chuàng)造出一些“生物機(jī)器人”,它們可以在生物體中自動(dòng)執(zhí)行一些特殊任務(wù),比如給癌細(xì)胞送藥、清除體內(nèi)微塑料等。
例如,用青蛙細(xì)胞創(chuàng)造出的一種名為“xenobots”的生物機(jī)器人,乍一看像是變形蟲之類微小的水生生物,一會(huì)兒繞著什么東西轉(zhuǎn)圈,一會(huì)兒來回巡邏,放佛在尋找什么。
與金屬和塑料機(jī)器人不同,它們不僅可以進(jìn)行新陳代謝,受到損壞后能自我修復(fù),還會(huì)響應(yīng)彼此的存在,表現(xiàn)出群體行為,甚至可能為多細(xì)胞生命的起源提供新視角。
活細(xì)胞機(jī)器人xenobots。|來源:Douglas Blackiston, Quanta Magazine
“帶貨”DNA納米機(jī)器人
我們研究機(jī)器人,最主要目的是讓它們自動(dòng)完成一些任務(wù)。對(duì)于生物機(jī)器人而言,最主要的一個(gè)用途就是“帶貨”,比如給癌細(xì)胞帶點(diǎn)藥,讓它們稀里糊涂被毒死。
可是要怎么制造生物機(jī)器人呢?科學(xué)家首先瞄上了DNA。
DNA具有自我折疊的特性,可以像玩折紙游戲一樣,自行折疊和組裝成形狀各異的二維圖案或三維空間結(jié)構(gòu),如五角星、笑臉、美洲地圖以及立方體等,被認(rèn)為是理想的帶藥載體。
2012年,哈佛醫(yī)學(xué)院的遺傳學(xué)家喬治·丘奇(George Church)教授帶領(lǐng)兩位博士,首次完成DNA給藥機(jī)器人的概念設(shè)計(jì)。他們經(jīng)過精確模擬計(jì)算,將一段7300多個(gè)堿基對(duì)的長單鏈DNA和近200個(gè)堿基對(duì)的短單鏈DNA組裝成一個(gè)六邊形的DNA納米管,管腔內(nèi)可以搭載一些蛋白和其他藥物分子。
DNA納米管可以識(shí)別特定的細(xì)胞表面抗原,從而準(zhǔn)確找到并結(jié)合到癌細(xì)胞上,然后自動(dòng)開啟表面的分子開關(guān),將封閉的納米管打開,釋放出搭載的藥物分子,直接殺死癌細(xì)胞,甚至讓癌細(xì)胞自殺。
六邊形DNA納米管。|來源:Science
2018年,DNA納米機(jī)器人的實(shí)際抗癌效果在動(dòng)物體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證。在《自然生物技術(shù)》雜志發(fā)表的一項(xiàng)研究中,DNA納米機(jī)器人攜帶著凝血酶(血液中重要的凝血因子,可形成血栓)進(jìn)入小鼠的腫瘤組織,結(jié)果在腫瘤組織內(nèi)形成血栓,導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞無法得到足夠的養(yǎng)分而生長停滯,甚至被活活餓死。
之后,研究人員在巴馬小香豬體內(nèi)觀察到類似情況,證明DNA納米機(jī)器人有望成為癌癥治療的新武器。
活細(xì)胞機(jī)器人也能帶貨?
之所以選擇DNA機(jī)器人帶藥,主要是因?yàn)镈NA具有生物相容性且容易降解,也就是說DNA機(jī)器人既能精準(zhǔn)“帶藥”,又不會(huì)給身體惹麻煩。
既然DNA可以,活的細(xì)胞是不是也可以呢?生物學(xué)家又想到讓細(xì)胞組團(tuán)來帶貨。
2020年初,計(jì)算機(jī)科學(xué)家約書亞·邦加德(Josh Bongard)與生物學(xué)家邁克爾·萊文(Michael Levin)合作,利用100%的非洲爪蟾細(xì)胞,創(chuàng)造出一種可編程、可自主移動(dòng)、可降解的活細(xì)胞機(jī)器人,將其命名為xenobots(爪蟾拉丁名“Xenopus laevis”和機(jī)器人“robots”兩個(gè)詞的結(jié)合),研究成果發(fā)表在《美國科學(xué)院院報(bào)》上。
首先,計(jì)算機(jī)專家借助超級(jí)計(jì)算機(jī)開發(fā)出一種復(fù)雜的進(jìn)化算法,來設(shè)計(jì)機(jī)器人模型。他們模擬出非洲爪蟾的皮膚和心肌細(xì)胞的最佳組裝方案,希望這些細(xì)胞能自主移動(dòng),甚至自動(dòng)修復(fù)。接下來,生物學(xué)家從非洲爪蟾胚胎中分離出干細(xì)胞,讓干細(xì)胞進(jìn)一步分化成皮膚細(xì)胞和心肌細(xì)胞。
根據(jù)超級(jí)計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì)的機(jī)器人模型,研究人員將皮膚細(xì)胞放在上層,將有運(yùn)動(dòng)能力的心肌細(xì)胞放在下層,中間則可設(shè)計(jì)成 “口袋”,以便于攜帶藥物。
根據(jù)不同設(shè)計(jì),這種活細(xì)胞機(jī)器人不僅能直線運(yùn)動(dòng),還會(huì)繞圈運(yùn)動(dòng),也可負(fù)重前行,具備遞送藥物或其他醫(yī)用材料的潛力。
利用非洲爪蟾的皮膚和心肌細(xì)胞組裝而成的活細(xì)胞機(jī)器人xenobots。|來源:Douglas Blackiston and Sam Kriegman
一年之后,研究人員再次改進(jìn)這種活細(xì)胞機(jī)器人,推出了xenobots 2.0。相關(guān)成果發(fā)表在2021年3月21日的《科學(xué)-機(jī)器人》雜志上。相比xenobots 1.0 ,xenobots 2.0主要具備六個(gè)新特點(diǎn):
一是只需一種細(xì)胞。新的設(shè)計(jì)只用到一種細(xì)胞,即非洲爪蟾的皮膚細(xì)胞,拋棄了原來充當(dāng)動(dòng)力的心肌細(xì)胞。因?yàn)榧?xì)胞種類更少,引發(fā)機(jī)體免疫排斥反應(yīng)也會(huì)越小。
二是可自動(dòng)組裝。由于單個(gè)細(xì)胞具有喜歡“抱團(tuán)”的特點(diǎn),可以實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞自動(dòng)組裝,不再需要進(jìn)行人工組裝。
三是運(yùn)動(dòng)速度更快。既然沒有心肌細(xì)胞,那么細(xì)胞團(tuán)的動(dòng)力來自哪里呢?原來非洲爪蟾皮膚上皮細(xì)胞表面能長出纖毛,可以以特定方式來回移動(dòng)或旋轉(zhuǎn),為細(xì)胞機(jī)器人提供動(dòng)力,速度甚至超過原來的心肌細(xì)胞。
四是存活時(shí)間更長。第一版細(xì)胞機(jī)器人大約只能存活1周左右,但是給這些細(xì)胞添加特殊的營養(yǎng)素后,可以存活超過90天。
五是具有自動(dòng)修復(fù)能力。新的細(xì)胞機(jī)器人即使被剪成兩半也能重新“抱團(tuán)”,大概在5分鐘內(nèi)即可恢復(fù)原有形狀并繼續(xù)工作,這點(diǎn)可能是金屬機(jī)器人、塑料機(jī)器人甚至是DNA機(jī)器人都無法比擬的。
六是具有記憶能力。研究人員通過熒光蛋白來檢測(cè)細(xì)胞機(jī)器人是否具有記憶力,熒光蛋白大多數(shù)時(shí)候是發(fā)綠光,只有在波長390納米的藍(lán)光照射下,熒光蛋白會(huì)發(fā)紅色熒光。當(dāng)研究人員讓10個(gè)細(xì)胞機(jī)器人在390納米藍(lán)光照射點(diǎn)附近活動(dòng),結(jié)果有3個(gè)細(xì)胞機(jī)器人發(fā)出紅光,而其他機(jī)器人則仍然保留綠色,表明這3個(gè)細(xì)胞機(jī)器人曾經(jīng)游進(jìn)過藍(lán)光區(qū)域。
細(xì)胞機(jī)器人即使被剪成兩半,也能迅速自我修復(fù)。|來源:Douglas Blackiston and Sam Kriegman
不止于機(jī)器人
之所以將這些微小的細(xì)胞團(tuán)稱為機(jī)器人,是因?yàn)樗鼈兡芨鶕?jù)提前設(shè)定的程序,以固定的形狀、固定的運(yùn)動(dòng)方式,去完成特定的任務(wù),如同常見的金屬機(jī)器人那樣。
在小范圍的模擬實(shí)驗(yàn)中,研究人員發(fā)現(xiàn),新版細(xì)胞機(jī)器人比舊版細(xì)胞機(jī)器人能更快更好地完成碎片收集任務(wù),覆蓋更大的面積,還能穿過狹窄的毛細(xì)血管。所以除了帶藥,研究人員還想讓這種細(xì)胞機(jī)器人充當(dāng)清潔工。例如,可以通過編程將細(xì)胞機(jī)器人釋放到海洋中,吸附微塑料顆粒,為清除海洋中的塑料污染提供一種更簡(jiǎn)便的方法。
雖然活細(xì)胞機(jī)器人有這么多實(shí)際用途,但關(guān)于活細(xì)胞機(jī)器人本身,仍有很多問題有待解答。例如,單個(gè)細(xì)胞為什么喜歡聚集成團(tuán)?細(xì)胞如何知道要組裝成多大規(guī)模然后停止?細(xì)胞機(jī)器人中成百上千個(gè)細(xì)胞如何協(xié)同一致工作?細(xì)胞機(jī)器人被切割后可自我修復(fù),之后會(huì)不會(huì)自我繁殖,甚至進(jìn)化成有機(jī)體?
這些問題的解答,將為我們理解一些生物如何進(jìn)行自我修復(fù)提供啟發(fā),更可能為研究多細(xì)胞生物的起源和演化提供新視角。通過創(chuàng)造活細(xì)胞機(jī)器人來反思生命本身的奧秘,或許才是活細(xì)胞機(jī)器人帶給我們更大的驚喜。
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