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毫無疑問,新冠將主導(dǎo)這一年最可能產(chǎn)生巨大影響的技術(shù)發(fā)展。
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NICK JACKSON:熱穩(wěn)定疫苗
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倫敦CEPI研發(fā)項目及技術(shù)負責(zé)人
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流行病防范創(chuàng)新聯(lián)盟(CEPI)是2017年成立的一個全球性聯(lián)盟,旨在開發(fā)針對新興傳染病的疫苗。CEPI關(guān)注不同疫苗技術(shù)的速度、規(guī)模和可及性,具體包括證明疫苗安全性和有效性的速度,如何大規(guī)模生產(chǎn)疫苗并向弱勢群體供應(yīng),從而確保人人都能獲得疫苗。
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這方面的緊迫性在新冠疫情中得到了最佳證明,脂質(zhì)納米顆粒包裹的信使RNA疫苗(mRNA)以破紀錄的時間走完了從測序到臨床概念驗證再到中期分析的流程。生物技術(shù)公司Moderna和輝瑞制藥公司只用了不到四個月就從測序進入到I期臨床試驗——這個速度是難以想象的,因為疫苗研發(fā)通常需要幾年甚至幾十年的時間。目前這些疫苗已經(jīng)開始了公眾接種。
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不過,mRNA疫苗還有提升的空間。最近的突破性創(chuàng)新是在將mRNA送入細胞的納米顆粒中使用可電離的脂質(zhì)。這些顆粒在生理pH值下保持中性,但進入細胞的核內(nèi)體時,它們會在細胞器的酸性環(huán)境中積聚電荷,這有助于釋放其包裹的mRNA。目前正在開發(fā)的下一代可電離脂質(zhì)納米顆粒將通過一種受體結(jié)合過程,把這些納米顆粒靶向到特定的組織或細胞類型。
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其他新技術(shù)可以改善疫苗的可及性。比如,一些技術(shù)利用糖分子進行快速凍干,這樣就不會破壞疫苗的精細結(jié)構(gòu)或配方,增加了儲存和運輸?shù)谋憷浴?/p>
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生物制藥公司CureVac的RNA打印機能迅速提供mRNA候選疫苗。來源:CureVac
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另一種增加疫苗可及性的途徑是開發(fā)便攜式RNA打印技術(shù)。只有為數(shù)不多的國家有資本和能力量產(chǎn)高質(zhì)量的疫苗,但在2019年2月,CEPI向生物醫(yī)藥公司CureVac投資了3400萬美元,幫助其開發(fā)一種完全可運輸?shù)难b置,這個裝置能讓資源匱乏地區(qū)自主生產(chǎn)mRNA疫苗。這類創(chuàng)新將增加疫苗的可及性,同時也讓我們看到了未來:對于不可避免的下一輪疫情,更多的國家將有更充足的準備。
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OFER YIZHAR: 大腦全息圖
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以色列魏茨曼科學(xué)研究所的系統(tǒng)神經(jīng)科學(xué)家
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光遺傳學(xué)(optogentics)是一種控制特定腦細胞和腦回路活動的技術(shù),自2005年問世以來在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域引起了不小的轟動。我預(yù)計這些工具將在2021年產(chǎn)生更大的影響。
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利用光遺傳學(xué),研究人員可以用光照射組織,所有表達該工具的神經(jīng)元都會做出反應(yīng)。然而在現(xiàn)實中,大腦活動要微妙得多。神經(jīng)元只對特定的刺激有反應(yīng)。時機很重要,順序也很重要,這些神經(jīng)元很少同時放電。自2005年起,光遺傳學(xué)讓我們能夠操縱特定類型的神經(jīng)元,但仍然不能復(fù)制細胞之間交流所用的語言。
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為了彌補這個缺陷,一些神經(jīng)科學(xué)家開發(fā)了新的光反應(yīng)蛋白,例如通過改變某個通道激發(fā)光的顏色,或使該通道保持更長時間的開放。其中一些修飾過的蛋白使我們能夠使用雙光子激發(fā)技術(shù)精確刺激神經(jīng)元,這是一種對活組織進行高分辨率成像的技術(shù)。然而,激光束激活單個神經(jīng)元的速度有限,這就限制了我們設(shè)計模擬自然活動的刺激模式的可靠性。
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與此同時,其他人在光學(xué)方面也取得了進展。過去幾年中,全息圖和其他用于操作單個神經(jīng)元的光學(xué)技術(shù)已經(jīng)足夠成熟,可以被非專業(yè)實驗室采用。通過將激光分裂成許多形成神經(jīng)元形狀的光束,就有可能產(chǎn)生全息圖,在三維空間以復(fù)雜的時間模式精確刺激神經(jīng)元。
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一束激光刺激一個神經(jīng)元可能需要10-20毫秒,而全息術(shù)可以在不到一毫秒的時間內(nèi)刺激這個細胞——這比信號從一個神經(jīng)元傳到另一個神經(jīng)元通常需要的4-5毫秒要快得多。此外,你也可以同時生成多個全息圖,或者以特定的順序生成這些全息圖。
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曾幾何時,這類實驗只在有能力定制顯微鏡的專業(yè)實驗室里開展;而現(xiàn)在,像布魯克(Bruker)和3i這樣的顯微鏡公司已經(jīng)在它們的雙光子成像系統(tǒng)中加入了全息技術(shù)。神經(jīng)科學(xué)家可以用顯微鏡拍攝照片,標記出他們想激活的神經(jīng)元,然后利用該軟件生成全息圖來匹配這些激活模式。在光遺傳學(xué)工具和光學(xué)技術(shù)的并行發(fā)展下,我們可以開始在單個神經(jīng)元的精度上研究神經(jīng)編碼。
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ALICIA CHENOWETH: 構(gòu)建更好的抗體
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倫敦國王學(xué)院癌癥免疫學(xué)家、2022年抗體生物學(xué)與工程戈登研究會議主席
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從上世紀90年代中期開始,抗體就被用來進行治療。但一直到最近幾年,科學(xué)家才逐漸弄清楚抗體的結(jié)構(gòu)會如何影響其功能,抗體的潛力才真正發(fā)揮出來。隨著疫情的持續(xù),抗體療法也面臨新的緊迫性。
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大多數(shù)抗體療法只是常規(guī)的、未修飾的抗體,它們能結(jié)合特定的靶標,這里的靶標可以是病毒或腫瘤細胞表面的某種蛋白質(zhì)。然而,這些抗體中有許多都無法使免疫細胞清除目標物質(zhì)。隨著分子生物學(xué)的進步,我們可以快速改進抗體,使其更好地調(diào)動免疫系統(tǒng)對抗疾病的能力。
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我的實驗室一直在用兩種不同的策略來改進抗體。利用PIPE(聚合酶引物不完全延伸)平臺——一種由加州Novartis研究基金會基因組研究所建立的快速高效的分子克隆方法,我們已經(jīng)將點突變引入抗體,使其更容易與自然殺傷細胞相互作用,增加乳腺癌模型小鼠的癌細胞死亡率。
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另外,我們已經(jīng)開始研究基于免疫球蛋白E(IgE)的抗體。大多數(shù)治療性抗體都是基于一個免疫球蛋白G骨架。人們通常認為IgE是一種與過敏反應(yīng)相關(guān)的可怕抗體。但事實上,如果能用IgE抗體激發(fā)這種很厲害的炎癥,這或許就能成為靶向癌細胞并將其殺死的好方法[4]。
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鑒于其多用途的特性,工程抗體的優(yōu)勢在于它們幾乎可以應(yīng)用于任何疾病,只要存在特定的靶點。因此,在我們研究癌癥的同時,其他科學(xué)家也在設(shè)計抗體來關(guān)閉免疫系統(tǒng),以治療自身免疫和過敏,或幫助免疫系統(tǒng)應(yīng)對傳染病,包括COVID-19。工程抗體的可能性是無限的。
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CORAL ZHOU: 三種單細胞測序技術(shù)的潛力
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加州大學(xué)伯克利分校的細胞和發(fā)育生物學(xué)家、2021年染色體動力學(xué)戈登研究會議主席
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人體細胞有許多不同的功能,但它們其實都來自同一個細胞和同一個基因組。那么,單個細胞是如何衍化出這么多不同類型的呢?
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三種新的單細胞測序技術(shù)令我激動,這三種技術(shù)可以幫助我們在胚胎發(fā)育的最初階段回答這個問題。一種是使用Hi-C方法研究基因組的三維結(jié)構(gòu),以研究處于早期發(fā)育不同階段的小鼠胚胎的單個細胞中的母系和父系染色體。利用這種方法,研究人員在去年3月報告稱,受精后親代基因組不會立即混合,從1個細胞到64個細胞之間有一段時間,此時母系基因組的結(jié)構(gòu)與父系基因組的結(jié)構(gòu)看起來不同。雖然我們不知道為何會有這種短暫的不對稱,但作者推測它在發(fā)育后期建立性別特異性基因表達程序中起到了一定作用。在那之前,我認為并無技術(shù)能實現(xiàn)這樣的發(fā)現(xiàn)。
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另一種叫做CUT&Tag的技術(shù)可以跟蹤基因組上特定的生化“標記”,以幫助研究這些化學(xué)修飾如何在單個活細胞中開關(guān)基因,而SHARE-seq結(jié)合了兩種測序方法來識別基因組中可被轉(zhuǎn)錄激活分子識別的區(qū)域。
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將這些工具應(yīng)用到處于發(fā)育階段的胚胎,我們就能創(chuàng)建一個路線圖,來闡明基因組結(jié)構(gòu)的特征在胚胎發(fā)育過程中如何決定細胞命運。
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TAKANARI INOUE: 感受細胞的力
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約翰斯·霍普金斯醫(yī)學(xué)院合成細胞生物學(xué)家、美國細胞生物學(xué)學(xué)會2019年會議“細胞生物學(xué)工具和裝置”專題的聯(lián)合組織者
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除了生長因子和其他分子,細胞也能感知物理力。這種對力的感知可以調(diào)控基因表達、增殖、發(fā)育,甚至是癌癥。
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力很難研究,因為我們只能看到它的作用,譬如用力推某物時,就能看到物體變形或移動。而現(xiàn)在,科學(xué)家可以利用兩種前沿工具對活細胞內(nèi)的作用力進行可視化和操縱,從而對物理力與細胞功能之間的因果關(guān)系進行前所未有的探索。
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第一個工具是蘇黎世聯(lián)邦理工大學(xué)(ETH)開發(fā)的GenEPi。GenEPi融合了兩個分子,第一種分子叫做Piezo1,是一種離子通道,當它感知到細胞膜上的張力時,就會引導(dǎo)鈣離子穿過其孔道。這些離子再利用第二種分子來檢測,當這種分子與鈣結(jié)合時,會發(fā)出更亮的熒光。
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以往的研究利用物理探針或其他侵入性設(shè)備來研究力對細胞的影響。而使用GenEPi則可以在生理相關(guān)條件下研究完整的細胞。與以前廣泛監(jiān)測細胞質(zhì)鈣的傳感器不同,GenEPi通過Piezo1測量只與力感知相關(guān)的鈣活性。作為概念驗證,研究人員用原子力顯微鏡懸臂的尖端刺激心肌細胞,改變了GenEPi熒光。
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第二個工具是ActuAtor,是我們基于致病菌單核細胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)的一種蛋白質(zhì)——ActA構(gòu)建的。當單增李斯特菌感染哺乳動物宿主細胞時,ActA會劫持宿主的相關(guān)機制,觸發(fā)微生物表面的肌動蛋白聚合,由此產(chǎn)生的力可以推動細菌穿過細胞質(zhì)。
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我們通過改造ActA來重新利用這種劫持作用,當受到光或化學(xué)刺激時,使肌動蛋白在細胞內(nèi)的特定位置聚合。利用ActuAtor,我們可以在細胞內(nèi)部施加力。例如,將ActuAtor應(yīng)用于線粒體表面可導(dǎo)致細胞器在幾分鐘內(nèi)被切割。我們發(fā)現(xiàn),這些受損的線粒體更容易被線粒體自噬降解,但關(guān)鍵的線粒體功能,如ATP合成,則不受影響。
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在此之前,類似的過程通常難以研究,因為我們?nèi)狈δ軌驅(qū)е禄罴毎麅?nèi)細胞器變形的特異性和非侵入性工具。據(jù)我們所知,ActuAtor是首個能夠做到這點的工具之一。
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Genio Technologies公司的MasSpec Pen被用來檢測腫瘤組織及其邊界。來源:Dr。 James Suliburk/Baylor College of Medicine
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LIVIA SCHIAVINATO EBERLIN:?臨床中的質(zhì)譜
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德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校分析化學(xué)家、美國Genio Technologies聯(lián)合創(chuàng)始人和首席科學(xué)官、2021年化學(xué)成像戈登研究會議主席
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質(zhì)譜法可以快速分析來自復(fù)雜樣品的成百上千個分子,具有高靈敏度和化學(xué)特異性。針對這些方法的生物醫(yī)學(xué)研究主要朝著兩個不同的方向進行:一些科學(xué)家正在開發(fā)高性能技術(shù)來更深入地研究生物組織;而我們實驗室正在簡化質(zhì)譜分析工具,用于協(xié)助醫(yī)生的臨床決定。
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MALDI(matrix-assisted laser desorption/ionization,基質(zhì)輔助激光解吸/電離)是一種分析生物組織的質(zhì)譜成像技術(shù)。但是,從組織中釋放分子并在真空條件下將其電離涉及繁瑣的過程。2017年,研究人員開發(fā)了一種MALDI系統(tǒng),從而能在正常環(huán)境中而不是在真空條件下操縱離子。這一進展簡化了MALDI的分析過程,并能將MALDI與其他技術(shù)相結(jié)合,包括熒光原位雜交顯微技術(shù)、生物發(fā)光成像、斷面成像和磁共振成像。這些多模態(tài)功能可以推動很多新的研究,比如以迄今最高的分子和組織學(xué)精度探測宿主-微生物相互作用和代謝變化。
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在臨床方面,我們實驗室發(fā)明了手持式質(zhì)譜分析系統(tǒng)MasSpec Pen,可以幫助外科醫(yī)生識別腫瘤組織及其邊界。我們的裝置可檢測代謝產(chǎn)物——體內(nèi)酶反應(yīng)的最終產(chǎn)物,從而區(qū)分正常組織和腫瘤組織。只需將一滴水滴到組織上,溶解代謝產(chǎn)物,然后利用質(zhì)譜儀對其中的分子成分進行分析。我們已經(jīng)在實驗室中獲得了正常組織和腫瘤組織代謝特征的分子圖譜,目前正在手術(shù)室測試這一工具。
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今年,我們計劃繼續(xù)在接受乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌手術(shù)或自動化前列腺癌手術(shù)的患者中評估MasSpec Pen。我們已經(jīng)將這項技術(shù)授權(quán)給了Genio Technologies公司。
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JONG-HEUN LEE: 嗅出疾病
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高麗大學(xué)材料科學(xué)家、2021年化學(xué)傳感器國際會議指導(dǎo)委員會成員
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為了檢測可能預(yù)示環(huán)境風(fēng)險或疾?。ò–OVID-19)的氣體混合物,研究人員希望能模擬人類嗅覺,分析我們都聞到了各種氣體。然而,與視覺、聽覺和觸覺不同,嗅覺的化學(xué)傳感器非常復(fù)雜,需要檢測數(shù)百乃至數(shù)千種化學(xué)物質(zhì)的混合物,且這些物質(zhì)往往是微量濃度。
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我的實驗室正在采取多種方法開發(fā)下一代人工嗅覺。其一是采用雙層設(shè)計增加氣敏材料的多樣性。例如,我們可以給10種不同傳感材料的每一種涂10層催化層,這些催化層可以微調(diào)每種材料的氣敏特性,從而制造出10 × 10,即100種不同的傳感器。這比分別涂100種不同的傳感材料容易多了。
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我們還需要讓傳感器的反應(yīng)速度更快。一種策略是通過模仿自然的分層結(jié)構(gòu),使傳感材料具有多孔性,比如能最大限度地吸收陽光進行光合作用的樹木,或是體積小但表面積大、能最大限度將氣體從主要氣道輸送到小分支的肺組織。
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人工嗅覺技術(shù)可以用于醫(yī)療診斷,舉例來說,檢測哮喘患者呼吸中高濃度的一氧化氮。其他相關(guān)應(yīng)用包括監(jiān)測空氣污染、評估食物質(zhì)量以及基于植物激素信號的智能農(nóng)業(yè)。
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