-“領雁金獎”獲得者章張:建立生物大數(shù)據(jù)中心
作者:丁若愚
發(fā)布時間:2021-01-19
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-“領雁金獎”獲得者章張:建立生物大數(shù)據(jù)中心

編者按:2020年,章張榮獲中國科學院大學(以下簡稱“國科大”)“領雁金獎”。“人生最巧妙的事情莫過于緣分”,他的學生劉琳回憶道,在一次西山秋游中,章張走到一處山坡,突然覺得似曾相識,趕緊掏出手機翻看,“章老師在手機里找到一張照片,是他2012年回國不久,帶學生在這里春游拍下的,于是我們就在原處,按照原來的動作又留念了一張”。七年光陰,歲月流轉,章張已褪去了初回國時青澀的外表,學生也培養(yǎng)了一批又一批,而不變的是章張對育人和科研工作的熱愛與執(zhí)著。

2018年7月,炎夏初至,蟬鳴驟起,牛廣藝完成了她在《Nucleic Acids Research》雜志的投稿。同年,牛廣藝所在的中國科學院北京基因組研究所共在該雜志發(fā)表7篇重要研究成果,在這張優(yōu)異的成績單中,有4篇是在牛廣藝師從的章張老師帶領下完成的。

攝影/涂植鵬?楊天鵬

章張,曾在美國耶魯大學從事博士后研究、在沙特阿卜杜拉國王科技大學擔任研究科學家,是首位入選國際生物審編學會執(zhí)行委員會的中國學者,豐富的海外科研經(jīng)歷讓章張成為他人口中“年輕有為”的代表。2011年,章張通過科院海外優(yōu)秀人才引進計劃回到祖國,現(xiàn)為國家基因組科學數(shù)據(jù)中心副主任、中國科學院大學崗位教授。

回國伊始,剛好趕上國家開始重視生物大數(shù)據(jù)的階段,在個人興趣和國家需要的雙重動力作用下,章張和生物大數(shù)據(jù)這一領域結下了不解之緣?!吧锎髷?shù)據(jù)的海量激增和人工智能的快速發(fā)展,使得生物信息學領域正在發(fā)生著翻天覆地的變化”,擁有扎實的計算機學科基礎的章張說道。

如今,圍繞國家基因組科學數(shù)據(jù)中心和國家生物信息中心的建設工作已步入正軌,這其中,離不開章張及其團隊堅持不懈的努力。“在生物大數(shù)據(jù)的海洋中乘風破浪”,既是章張回國幾年的日常寫照,也是我國生物信息領域不斷發(fā)展的縮影。

趕上國際步伐

在世界上,被國際認可的生物信息中心有三個,分別是美國國家生物技術信息中心NCBI、歐洲生物信息研究所EBI和日本核酸數(shù)據(jù)庫DDBJ,他們共同掌握著國際上主要的生物數(shù)據(jù)資源。上世紀90年代,我國的老一輩院士開始呼吁建設國家級的生物數(shù)據(jù)中心,直至今日,歷經(jīng)20年,這個愿望終于實現(xiàn)。

“提起生物大數(shù)據(jù),也許很多人會感到陌生,它看不見、摸不到。但其實,生物大數(shù)據(jù)和石油一樣,屬于國家基礎性戰(zhàn)略資源,在生物學、醫(yī)學甚至農(nóng)學等學科都起著非常重要的作用?!闭聫?zhí)岬?,傳統(tǒng)的生物學是觀察型學科,隨著人類基因組計劃的完成,生命科學和醫(yī)學將過渡到數(shù)據(jù)科學,所以在未來,生物醫(yī)學領域的數(shù)據(jù)也會因此而呈爆炸式增長?!拔覀兊牡厍蛏嫌薪?5億人,每個人的生理狀況各不相同,使用生物大數(shù)據(jù),就能針對每個病人的具體情況給出最精準的治療方案,或者在人們健康的時候,能提前預知身體可能出現(xiàn)的病變,為預防工作提供一個可靠的指導”。比如華為、騰訊等公司已開始使用生物大數(shù)據(jù)來觀察人們的健康狀態(tài),例如判斷病人是否患了腫瘤,通過基因組觀察腫瘤患者的潛在特征,為疾病預防、診斷、預后等精準治療提供分子依據(jù)等。

我國的生物大數(shù)據(jù)中心與國際相比起步較晚:2015年醞釀,2016年中國科學院北京基因組研究所成立“生命與健康大數(shù)據(jù)中心”,2019年,國家批準成立“國家基因組科學數(shù)據(jù)中心”和“國家生物信息中心”,這表明我國對生物大數(shù)據(jù)等領域的建設越來越重視。

建立生物大數(shù)據(jù)中心

說到生物大數(shù)據(jù)中心的成立,章張用了“一窮二白”和“摸索前行”兩個詞來形容?;I建前期,研究所里相關領域的幾個課題組在不同的方向積極開拓,雖然建立了一些數(shù)據(jù)庫,但還不夠完善,卻為以后的發(fā)展積攢了重要的經(jīng)驗和技術。2016年,才有了“生命與健康大數(shù)據(jù)中心”的誕生。

既然要做,就要做到最好。在生命與健康大數(shù)據(jù)中心成立初期,章張及其團隊就將目標鎖定為國際三大數(shù)據(jù)中心,開始了艱難“創(chuàng)業(yè)”。首先是梳理數(shù)據(jù)、查漏補缺,章張把每個課題組的前期基礎進行了優(yōu)化整合,從數(shù)據(jù)的不同層次、類型和角度把數(shù)據(jù)資源體系建立起來。之后,又采取“請進來、走出去”的方法,積極向國際三大數(shù)據(jù)中心學習,成立國際科學咨詢委員會,邀請國際知名專家給予寶貴建議和意見,團隊成員多次赴美國NCBI、歐洲EBI等多個機構學習交流經(jīng)驗,正如章張所說:“我們把口號喊出來了,就得拼盡全力?!?/p>

科研之路從來都不會是一帆風順的。在生命科學領域發(fā)表文章時,按慣例需要把所有的數(shù)據(jù)提交到國際三大生物數(shù)據(jù)中心,但這些數(shù)據(jù)對于我國的科研工作者來說,是極其寶貴的資源。尤其是生物數(shù)據(jù)具有“海量”的特點:普通的電腦硬盤是1TB,1TB等于1024GB,一篇論文的數(shù)據(jù)可能就會有幾十TB甚至上百TB之多。拋開復雜多變的國際形勢不談,一旦遭遇自然災害等意外,就會嚴重影響到我國相關領域的科研進程。

比如在2006年,一場地震造成了太平洋海底光纜故障,導致了我國學者在一段時期內無法訪問國外數(shù)據(jù)庫的情況出現(xiàn)?!翱茖W無國界,但科學家有祖國”。我國的學者一直希望把這些珍貴的研究成果和數(shù)據(jù)保留一份在國內,用于祖國建設和民生福祉。為此,在中心籌建伊始,章張團隊就未雨綢繆,與各大期刊及學者溝通合作,把科學數(shù)據(jù)管理的本土化工作做到了前面,為我國數(shù)據(jù)安全管理和共享利用提供了有力保障。

是學者,亦是師者

2020年秋天,章張成為國科大“領雁金獎”的獲得者,這既是對他身為一名“學者”,懷抱信念、學識扎實的肯定,也是對他作為一位“師者”,以身作則、仁愛仁心的認同。

談到人才培養(yǎng),章張娓娓道來:“我認為學生培養(yǎng)最重要的一條就是因材施教、因人而異,因為每個學生的學科背景和興趣方向都不一樣。每當招收新生時,我都會告訴他們,這幾年你們在學業(yè)方面最重要的一個人就是我,所以一定要把個人訴求和想法告訴我,充分溝通后,我可以把實現(xiàn)的途徑以及前景勾畫出來,避免你們走太多彎路和錯路。”

章張很愿意花更多時間去陪學生,和他們溝通科研問題、了解他們的學習生活。在章張眼中,判斷一個人熱愛的標準,是看他是否愿意為之付出時間。而用大量精力引導學生,就是章張愛學生最好的證明。

對于團隊建設,章張認為一支隊伍,最重要的就是團結和合作。章老師經(jīng)常鼓勵學生在完成自己課題的同時,多多參與組內其他課題的研究?!鞍炎约喉椖孔錾睿巧疃?;和其他項目合作,是廣度。同時擁有兩個維度的鍛煉,對于學生來講是大有好處的。”章張希望,從自己團隊走出來的學生,在經(jīng)歷了雙維度訓練后,都能成為個人水平突出、協(xié)作能力優(yōu)秀的全能型人才。

之所以說章張是才兼文武的“神仙”導師,是因為除了學術,章老師還是一位體育健將。工作之余,章張經(jīng)常通過帶學生踢球、爬山、散步等方式,來緩解大家科研方面的壓力。劉琳是章張的博士研究生,然而,擅長學術研究的她對戶外運動方面興趣全無?!袄蠋熃?jīng)常會帶我們去奧林匹克公園散步,我是一個很宅的人,老師有時候看我太懶了,就會來我們辦公室,‘抓’我們出去鍛煉?!焙髞?,章張在和另一位學生散步時,偶爾討論出了一個新的課題方向,“這個消息讓我們都特別振奮,這下都愿意和老師出去散步鍛煉了,哈哈?!?/p>

“人生最巧妙的事情莫過于緣分”,劉琳回憶道,在一次西山秋游中,章張走到一處山坡,突然覺得似曾相識,趕緊掏出手機翻看,“章老師在手機里找到一張照片,是他2012年回國不久,帶學生在這里春游拍下的,于是我們就在原處,按照原來的動作又留念了一張?!逼吣旯怅?,歲月流轉,章張已褪去了初回國時青澀的外表,學生也培養(yǎng)了一批又一批,而不變的是對育人和科研的熱愛與執(zhí)著。

“北京有家燒烤叫柳葉刀,如果能在《柳葉刀》期刊發(fā)表一篇文章,就可以在那里免費吃一頓”,章張說道,“有時候學生發(fā)了文章,我就會帶著他們去那里聚一聚,邊吃邊‘立志’?!边@家飯店會根據(jù)發(fā)表論文的影響因子給予相應的折扣,雖然現(xiàn)在已經(jīng)不提倡關注文章的影響因子,但師生間的樂趣在于科研壓力之余的一期一會,和久違小聚時的一談一笑。

人能盡其才則百事興,如今,國家基因組科學數(shù)據(jù)中心在章張及其團隊的努力下已初具規(guī)模,但由于我國在這方面起步較晚,要做的事情還有很多。對于未來,章張期望國家可以對生物信息學的作用給予持續(xù)的關注與支持,希望包括數(shù)學、計算機、物理、化學、醫(yī)學等不同學科背景的人才,可以投身到生物信息學研究領域來。(原標題:章張:才兼文武的“神仙”導師 作者系國科大記者團成員)



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